中朝聞警，兵部尚書王永光大集廷臣議戰守，無良策。經略第、總兵麒並擁兵關上，不救.

天啟二年正月，朝覲在都，禦史侯恂請破格用之，遂擢兵部職方主事。無何，廣寧師潰，廷議扼山海關，崇煥即單騎出閱關表裡。部中失袁主事，訝之，家人亦莫知所往。已，還朝，具言關上情勢，曰：“予我軍馬錢穀，我一人足守此。”廷臣益稱其才，遂超擢僉事，監關外軍，發帑金二十萬，俾招募。

崇煥又言：“以臣之力，製全遼不足，調眾口不敷。一出國門，便成萬裡，忌能妒功，夫豈無人。即不以權力掣臣肘，亦能以定見亂臣謀。”帝起立聆聽，諭之曰：“卿無疑慮，朕自有主持。”大學士劉鴻訓等請收還之臣、桂尚方劍，以賜崇煥，假之便宜。帝悉從之，賜崇煥酒饌而出。崇煥之前此熊廷弼、孫承宗皆為人排構，不得竟其誌，上言：“規複之計，不過臣昔年以遼人守遼土，以遼土養遼人，守為正著，戰為奇著，和為旁著之說。法在漸不在驟，在實不在虛，此臣與諸邊臣所能為。至用人之人，與為人用之人，皆至尊司其鑰。何故任而勿貳，信而勿疑？蓋馭邊臣與廷臣異，軍中可驚可疑者殊多，但當論成敗之大局，不必摘一言一行之微瑕。事任既重，為怨實多，諸無益於封疆者，皆倒黴於此身者也。況圖敵之急，敵亦從而間之，是覺得邊臣甚難。陛下愛臣知臣，臣何必過疑懼，但中有所危，不敢不告。”帝優詔答之，賜蟒玉、銀幣，疏辭蟒玉不受。

我大清知經略易與，六年正月舉雄師西渡遼河，二十三日抵寧遠。崇煥聞，即偕大將桂，副將左輔、朱梅，參將大壽，守備何可剛等集將士誓死守。崇煥更刺血為書，激以忠義，為之下拜，將士鹹請效死。乃儘焚城外民居，攜守具入城，清野以待。令同知程維楧詰奸，通判啟倧具守卒食，辟道上行人。檄前屯守將趙率教、山海守將楊麒，將士逃至者悉斬，民氣始定。明日，雄師打擊，載楯穴城，矢石不能退。崇煥令閩卒羅立，發西洋巨炮，傷城外軍。明日，再攻，覆被卻，圍遂解，而啟倧亦以然炮死。

雄師亦旋引去，益兵攻錦州。以溽暑不能克，士卒多毀傷，六月五日亦引還，因毀大、小淩河二城。時稱寧、錦大捷。

世祿等將行，大清已於二十八日分兵趨寧遠。崇煥與中官應坤、副使畢自肅督將士登陴守，列營濠內，用炮距擊；而桂、世祿、大壽大戰城外，士多死，桂身被數矢。