1582年6月2日，織田信長遭到家臣明智光秀的背叛，喪命於京都本能寺當中。得知織田信長的死訊後，足利義昭便將重回京都的但願依托在了繼織田信長而起的氣力派大名身上，但是各大名在織田身後爭權奪利，得空顧及足利義昭的要求，足利義昭的迴歸京都之夢彷彿又變得遙遙無期了。

1573年，在織田信長的逼迫下，足利義昭將2歲的兒子送往織田信好處做人質，本身則被逐出京都，室町幕府宣佈滅亡。固然幕府滅亡，本身四周流落，但足利義昭卻不甘心就此認輸。他向一些權勢較小的處所大名收回要求，但願能獲得他們的援助，再次回到京都。但是這些大名並冇有承諾他的要求，啟事很簡樸，如果接管了足利義昭的要求賜與援助，必將引來殺身之禍。足利義昭轉而向彆的大名提出顛覆織田信長的要求，均遭到了回絕。

叛軍頭領鬆永久秀見此景象，急命由他親身練習的洋槍隊射殺足利義輝，這位身中數槍的幕府將軍在奮力斬殺了數名敵軍後，倒地而亡，時年30歲。足利義輝身後，鬆永久秀擁安身利義輝的堂弟足利義榮繼任為室町幕府的第14代將軍，但真正應當具有將軍擔當權的是正在興福寺削髮的足利義輝的親弟足利覺慶。

1587年，在外流落流落多年的足利義昭受豐臣秀吉恩賜獲得了安居之所，但是一年後的春季，這位名存實亡的幕府將軍再次削髮。1597年8月28日，足利義昭病死於大阪，享年61歲。

1565年5月19日淩晨，一隊人馬悄悄包抄了京都的幕府禦所。這是一場蓄謀已久的行動，他們的目標是要撤除禦所的仆人――室町幕府第13代將軍足利義輝。現在，一身戎裝的足利義輝已經從侍衛口中獲得了動靜。他和老婆停止了最後的晚宴，在老婆的衣袖上題了一首去世歌後，足利義輝帶領30餘名侍衛衝向敵陣。

足利義輝曾經向新陰流鼻祖上泉信綱和新當流開山祖師塚原卜傳兩大劍術大師學習過劍法，劍技高深，技藝高強，被世人譽為劍豪將軍，部下侍衛個個勇猛善戰，加上逢此存亡存亡之時，更是極力死戰，以一當百，將來犯之敵一一斬殺，使敵軍冇法近身。

無法之下，足利義秋找到織田信長，織田信長承諾幫足利義秋奪回征夷大將軍之位。此時，足利義秋改名為足利義昭。

坐上大將軍之位的足利義昭覺得自此今後本身就能號令天下，但是很快他發明，事情的生長並冇有設想中那麼順利。他的行動到處遭到織田信長的束縛，冇法利用將軍的權力，本身的處境與傀儡無異。為了早日擺脫這一景況，足利義昭大要對織田信長言聽計從，公開裡卻以大將軍的身份奧妙聯絡了武田信玄、淺井長政、朝倉孝景等反織田信長權勢，籌辦合力顛覆織田信長，這就是所謂的“織田包抄網”。但“織田包抄網”很快被織田信長崩潰，勢單力薄的足利義昭冇法抵擋織田信長的守勢，雖有正親町天皇居中補救，但是足利義昭和織田信長的分裂就此必定。