叛軍頭領鬆永久秀見此景象，急命由他親身練習的洋槍隊射殺足利義輝，這位身中數槍的幕府將軍在奮力斬殺了數名敵軍後，倒地而亡，時年30歲。足利義輝身後，鬆永久秀擁安身利義輝的堂弟足利義榮繼任為室町幕府的第14代將軍，但真正應當具有將軍擔當權的是正在興福寺削髮的足利義輝的親弟足利覺慶。

1587年，在外流落流落多年的足利義昭受豐臣秀吉恩賜獲得了安居之所，但是一年後的春季，這位名存實亡的幕府將軍再次削髮。1597年8月28日，足利義昭病死於大阪，享年61歲。

坐上大將軍之位的足利義昭覺得自此今後本身就能號令天下，但是很快他發明，事情的生長並冇有設想中那麼順利。他的行動到處遭到織田信長的束縛，冇法利用將軍的權力，本身的處境與傀儡無異。為了早日擺脫這一景況，足利義昭大要對織田信長言聽計從，公開裡卻以大將軍的身份奧妙聯絡了武田信玄、淺井長政、朝倉孝景等反織田信長權勢，籌辦合力顛覆織田信長，這就是所謂的“織田包抄網”。但“織田包抄網”很快被織田信長崩潰，勢單力薄的足利義昭冇法抵擋織田信長的守勢，雖有正親町天皇居中補救，但是足利義昭和織田信長的分裂就此必定。

甲冑入庫今後是歌舞昇平，全盛期間過後是滿目瘡痍。作為室町幕府第15代征夷大將軍，足利義昭應當很想再回到疇前那段波瀾壯闊。幕府把持天下的名勝當中去。隻可惜，好夢不常有，好花不常開，實際帶給這個運氣不濟的幕府將軍的是一次次的絕望和感喟。更加可悲的是，他的絕望和感喟老是遭到各地保護大名的嘲笑和捉弄。在被強權人物幾次稱為“窘蹙公方”之前，足利義昭的終究運氣早已必定下了。

1568年，織田信長帶領雄師，一起過關斬將，順利攻入京都，鬆永久秀投降。進入京都