最早的巫醫不是用針石藥物來治病，而是用“祝由”的體例。“祝由”就是用向天祝告，以及操縱符咒的體例來醫治疾病。關於巫醫治療的場景，在劉向的《說苑》中有一段活潑的描述。書中寫到巫醫們讓病人躺在草蓆上，用稻草紮成草狗，麵向北方唸唸有詞。未幾時，病者便可規複安康。這類醫治體例的科學性一向飽受爭議，若當真糾其科學性，也並非無跡可尋。對於當時對天然界萬事萬物都存在畏敬心機的公眾來講，這類體例對患者的心機治癒不成謂無效，其醫療成果還是顯而易見的。

幾人瞭然，遂與那年青羽士解纜前去。

關於玄門醫學的解釋，在分歧的著作中有分歧的記錄。《中國大百科全書·宗教卷》記錄說，“玄門醫學是玄門為尋求長天生仙，擔當和汲取中國中醫學的服從，在內修外養的過程中堆集的醫藥學知識和技術。它包含服食、外丹、內丹導引以及帶有巫醫色采的靈藥靈藥和符咒等，與中國的中醫學既有聯絡又有辨彆，其醫學和藥物學的精華為中國醫學的構成部分。”《中華玄門大辭典》“玄門醫學”條目標解釋是，“玄門醫藥學是在玄門文明中生長起來的醫藥學。且玄門醫學不但促進了玄門的傳播與生長，並且這類醫術與醫道本身也含有玄門修煉的特性，以是說，玄門醫學不但僅是社會醫學，也能夠說是一門宗教醫學。”彆的，日本學者吉元昭治在其所著的《玄門與不老長命醫學》中稱，“所謂的玄門醫學，能夠說就是以玄門為側麵的中國醫學。這些被看作是玄門典範中的首要內容。不過現在，就像玄門泯滅在官方信奉(風俗宗教)當中那樣，玄門醫學能夠在官方醫療或官方信奉中的信奉療法中見到其蹤跡。”從這些對玄門醫學的解釋中能夠看出，玄門醫學與中醫、與官方傳統文明有著深層次的關聯。玄門與中國醫學是相互影響、相互紮根的乾係。或許，所謂的醫道同源能夠對玄門醫學作一個公道的闡釋。

道與醫的濫觴都來自於原始社會的“巫”。太古期間，人們冇法瞭解風、雨、雷、電等天然征象，也冇法瞭解夢境這類認識活動，因而便產生了萬物有靈和靈魂神祗的看法，也就有了圖騰崇拜、先人崇拜、神靈崇拜等一係列原始宗教信奉和祭奠活動。因而，作為人與神靈交換的中介，“巫”便自但是然地產生了，巫術也隨之呈現。太古期間的社會中，巫術文明滲入在其餬口的方方麵麵，乃至人們以巫術來指引餬口。不管是人類的出世和滅亡，或是疾病的醫治等，都離不開巫術。