《內景經》提出“三丹田”之說。關於三丹田之名，在此經之前的初期玄門籍中尚未呈現。《承平經》、《大洞真經》提到泥丸、心、臍等與之相乾的稱呼，隻要到了《內景經》才明白提出“三丹田”的觀點。丹田有上、中、下之分，故合作“三田”。每一丹田中各居著一名神，故有“三神”。又因丹田之室，周遭一寸，故稱寸田，上麵彆離簡介三丹田。

關於下丹田：又叫氣海、精門、名關元、命門等，在臍下三寸處。經中報告下丹田的首要性：“或精或胎彆執方，核孩合延生華芒。”道經以為下丹田是性命的根底、陰陽的流派、五氣的本元；是男人藏精、女子藏胎之處，內有真神赤子居住，故稱下丹田為“命門”、“生門”或“生宮”。“核孩”，指宮中的陰陽神名，也叫“伯桃”，字“合延”。人們若意守下丹田，存思陰陽之神，則陰陽之氣不衰，生命不枯。

與三丹田相對應，《內景經》還提出三黃庭之說。上黃庭宮在腦中，與上丹田呼應；中黃庭宮也與中丹田分歧，都在心中；隻是下黃庭宮在脾中，與下丹田不分歧。總而言之，《內景經》就是以三丹田和三黃庭為關鍵，重視存思三部八景二十四真神，誇大堆集精氣作為長生要訣，即“神仙羽士非有神，積精累氣覺得真”。

肝屬東方木位，主青，故肝氣暢旺清並且長時，如東方之木主春，肝為活力之本，閉目冥想活力遍照體內五臟之腑，與臟腑呼應，上為五色雲，如日月星鬥亮光亮徹，久久便可本身內視臟腑。“內視”是存思法中一種首要思惟，就是指修煉者閉目存思，潛神入定後，內觀形體，神情充滿而使體內朗然洞徹的氣象。關於存思脾神：“脾長一尺掩太倉，中部老君治明堂，……黃衣紫帶龍虎章，長精益命賴君王，三呼我名神自通。”脾居中宮，存思脾神，便可增加精氣，耽誤命命，心虛洞鑒，神靈自通。關於存思肺神：“肺部之宮似華蓋，下有孺子坐玉闕。……素錦衣裳黃雲帶，喘氣呼吸體不快，急存白雲和六氣，神仙久視無災害，同之不己形不滯。”肺為金宮，在五臟之上，狀似華蓋。