清乾隆天子感覺袁崇煥的死值得憐憫，民國初年，梁啟超在《袁崇煥傳》中對袁崇煥大加讚美，以為他是能影響國度安危、民族興亡的人。1952年，北京市停止大範圍的改革都會扶植時，葉恭綽等聯名上□□，要求庇護袁墓，□□在答覆中稱袁崇煥為“明末愛國魁首”。

殺毛文龍

崇禎二年（1629年），駐守寧遠的來自於川、湖等地的兵士因為軍餉的事而叛變，袁崇煥用計將其安定。而後袁崇煥要求將寧遠、錦州合為一鎮，讓祖大壽鎮守錦州，何可剛替代朱梅駐寧遠，趙率教守關門，袁崇煥自駐寧遠，同時上書給朱由檢死力獎飾祖大壽等三人的才氣，並說本身五年複遼的打算端賴這三人來實現，如果五年後冇有實現，他將親手將這三人斬殺，本身到司法部分領罪服死。朱由檢加封袁崇煥為太子太保，並賜給蟒衣銀幣。[28]

但後金軍退兵後，袁崇煥卻被定罪。當初後金軍進入的關隘是屬於薊遼總理劉策所統領，而袁崇煥得知後金軍入關，直逼都城，因而千裡迢迢趕來救濟，自以為有功無罪，但是朝中大臣卻有很多人以為是袁崇煥放清兵入關，因而紛繁誹謗袁崇煥與後金軍有勾搭，朱由檢對此也很思疑。此時後金軍也設想誹謗，說袁崇煥與後金軍有奧妙商定。十仲春，朱由檢將袁崇煥下獄。[39]

魏忠賢遺黨王永光、高捷、袁弘勳、史褷等人想趁機給魏忠賢報仇，以私行與後金軍媾和、擅殺毛文龍兩條罪名定袁崇煥極刑，崇禎三年（1630年）八月，袁崇煥被淩遲正法，家人被流徙三千裡，並抄冇產業。

《劍橋中國明朝史》稱：“他（崇禎天子）信賴了謊言，於1630年9月22日在北京殺了他最有才氣的將領袁崇煥。”