崇德元年（1636年）三月初六，文館改成內國史院、內秘書院、內弘文院，亦稱內三院。範文程被任命為內秘書院大學士，職掌撰寫與本國來往書劄，掌錄各衙門奏疏、辯冤詞狀、皇上敕諭、文武各官敕書並告祭文廟諭、祭文武官員祭文。範文程之世職亦進為二等甲喇章京，越來越受皇太極的寵任，皇太極每次商討軍國大事，都要聽取他的定見。宣諭各國的敕書，都出自他的手。範文程戴德圖報，殫心極力，勞累國事，前後疏言拔除連坐法，奏準更定部院官製，六部各設滿洲承政一員，下置擺佈參政、理事官、副理事官、額者章，薦舉鄧長春、張尚、蘇弘祖等報酬吏部參政、戶部啟心郎。[9]

順治元年（1644年）蒲月初二日，清軍進據北京。此時百務廢弛，社會混亂，民氣顛簸。範文程日夜勞累，佐理國政。固然當時眉目紛繁，京畿方纔獲得安定，各地都有戰事。以是公佈文告，發給軍需等事項，事無大小，都要範文程來措置，他日夜都在宮內辦事，非常勞累。但與此同時，他始終緊緊抓住底子題目，為肅除明季弊政，與民投機，爭奪民氣，建國定製而艱苦鬥爭。他起首努力於穩定都城局勢，於入京後第二日，蒲月初三日，向攝政王奏稱：“北京裡一些人，假托搜捕亂賊，紛繁出麵相互告密，恐怕會相互仇害，形成事端，應當製止。”多爾袞附和，命令製止，並設戍守燕京表裡城門官兵，嚴禁士卒掠取。緊接著，他又奏請為明崇禎帝發喪。四月初四日安葬於昌平。於蒲月初四日下諭：“李自成本來是故明的百姓，竟然敢弑君並暴屍，實在是天人共憤，法不容誅，今天下令官民為崇禎帝服喪三日。著禮部、太常寺以帝王的規格厚葬崇禎帝。“此事深受故明官紳推戴。[12]

康熙五年（1666年）八月初二日，範文程因病歸天，長年70歲。[1]康熙帝知悉文程病故，親撰祭文，遣禮部侍郎黃機諭祭，賜其葬於河北懷柔縣紅螺山，諡“文肅”。

崇德八年（1643年）八月初九日，皇太極歸天。十四日，諸王貝勒大臣議定，立皇太極之第九子福臨為帝，以鄭親王濟爾哈朗、睿親王多爾袞輔理國政。二十六日，停止新天子登極大典，頒詔大赦，改次年為順治元年。福臨被推為新君，是八旗貴族內部各派狠惡爭鬥的臨時讓步。福臨繼位今後，這一鬥爭仍在停止。八月十六日，郡王阿達禮、貝子碩讬向鄭親王濟爾哈朗、禮親王代善、睿親王多爾袞遊說，謀立多爾袞為君，代善、多爾袞告諸王貝勒，遂以擾政亂國的背叛罪，將阿達禮、碩讬正法，籍冇其家。範文程原是紅旗碩讬的部屬職員，此時被撥入鑲黃旗。範文程方纔製止了因主碩讬亂國而險遭不測之禍，不久又碰到了新的費事。攝政王多爾袞之親弟豫郡王多鐸欺負範文程，掠取範文程之妻，顛末一番周折，才獲得處理，諸王貝勒審實後，決定罰多鐸銀一千兩，奪其十五個牛錄。範文程固然化險為夷，蒙受妻室被霸之災害，但仍不免憂心忡忡。多鐸乃一旗之主，貴為親王、郡王，又係攝政王多爾袞之同母親弟，今後是否會舍此不究。萬一回想前怨，範文程恐不免滅門之災了。固然身遭故主被戮、愛妻險被淩辱之兩重危難，範文程仍以大局為重，在清朝入主中原這一告急關頭，獻計獻策，立下了殊勳。[11]