公元660年，新羅王再次向唐朝求援，唐高宗遂以左武衛大將軍蘇定方為神丘道行軍大總管，帶領水陸雄師10萬餘人，從成山渡海向百濟建議打擊。百濟軍屯守熊津口停止抵當，但在唐軍南北夾攻之下，很快潰敗，隨後唐軍與新羅兵合一處，向百濟都城泗沘進軍，10天不到，便滅了百濟國。

在毀滅蘇我氏中立下汗馬功績的中大兄皇子，並冇有順從皇極天皇的意義擔當皇位，而是服從了中臣鐮足的定見，推舉本身的孃舅輕皇子擔當皇位。公元645年6月14日，輕皇子即位，是為孝德天皇。孝德天皇即位後，建立了日本最早的年號“大化”，開端了以中大兄皇子為主導的改革，史稱“大化改新”。

中日兩軍初次接戰的成果，據《舊唐書．劉仁軌傳》的記錄，“四戰捷，焚其舟四百艘，煙焰漲天，海水皆赤，賊眾大潰”。初戰得勝後，日軍並冇有撤兵，而是於第二天結合百濟軍又再次向大唐水軍建議打擊，成果“大唐便自擺佈夾船繞戰，斯須之際，官軍敗績，赴水滅頂者眾，艫舳不得迴旋。樸市田來津仰天而誓，切齒而嗔殺數十人，於焉戰死”。

公元645年6月12日，皇極天皇籌辦在板蓋宮大殿訪問來自朝鮮半島的使者，遵循以往天皇訪問本國使者的常例，把持朝政的大貴族蘇我入鹿必會參加。蘇我氏自蘇我稻目以來，擅權專政近百年，飛揚放肆，肅除異己，僭越皇權，橫霸於世，而蘇我入鹿，更是為人殘暴，乃至逼迫聖德太子的兒子山背大兄皇子自刎。傳說在山背大兄皇子死去的那一刻，天降祥雲，光彩奪目，而當蘇我入鹿昂首瞻仰時，天空卻俄然變成了玄色。

當天，就在皇極天皇接管外使獻上的禮品時，中臣鐮足命佐伯連子麻呂脫手，但冇想到，平時剛毅英勇的佐伯連子麻呂現在卻膽怯起來，遲遲冇有脫手。就在這時，中大兄皇子拔出本身的劍刺傷了蘇我入鹿，佐伯連子麻呂這才壯起膽來，一劍刺入蘇我入鹿的喉嚨，割下了他的首級。而後用草蓆裹屍，棄於荒漠。蘇我入鹿被勝利誅殺後，中大兄皇子很快分化崩潰了蘇我氏的軍隊，蘇我入鹿的父親蘇我蝦夷也自焚而亡，蘇我氏一族今後一蹶不振，走向式微。

日本在白村江海戰中固然蒙受了慘敗，但是這並冇有影響它與唐朝的來往，而唐朝也冇有因為日本本來支撐百濟國而對它冷淡，相反，兩國的乾係在海戰以後變得更加密切。公元669年，日本派河內鯨為“平高麗道賀使”前去唐朝都城長安，慶祝大唐在朝鮮半島的完整勝利。與此同時，日本開端主動選調派唐使，政治上生長與唐朝的睦鄰乾係，文明上主動汲取唐朝豐富的典章軌製，使得日本社會進入了一個全新的生長階段。