遵循TV版與舊劇院版的劇情，人類補完打算，彆離由SEELE和碇元渡這兩條線在停止。並且停止過程中有相互交叉牴觸的處所，比如說在對初號機的操縱上，SEELE之前並未籌算將初號機作為最後處刑的工具，之以是最後不得不利用初號機，是因為落空了原版朗槍的環境下已經冇法利用莉莉絲實施處刑，以是隻能利用莉莉絲的“獨一兼顧”初號機。而另一方麵，初號機是否能成為神對於碇元渡來講是相稱首要的。因而在這個題目上兩邊就有了必定的牴觸。

如果碇源渡勝利了，起首SEELE是必定要被他剿除的，那是對他最大的威脅，當然EVA各機體也必定要毀掉。其次是淺顯人，碇源渡最有能夠的做法是當上這個天下的帶領者，他已經是神了嘛，碇唯天然成了神後，然後就是千秋萬代，一統江湖。但是這些實在都是黃粱好夢，最後故事的生長並冇遂了碇源渡的心願，啟事隻要一個，綾波的叛變。

“腳本剛開端就出了偏差，碇，你要賣力。”

“這個是不測環境，啟事已經查明，駕駛員被使徒之血淨化導致初號機失控，詳細陳述我會在三天內提交。”老碇辯白道。

說完了SEELE，再轉頭來實際一下碇源渡這方麵的實在企圖。固然他也不是甚麼好人，比擬較而言，卻比SEELE要有情麵味兒很多。

在此以後，SEELE忙不迭地製定人類補完打算，緊接著又報酬激發了第二次打擊，以後一邊不吝巨資建立NERV及其配套設施（包含EVA零號機到伍號機），一邊催促碇源渡從速照他們的要求停止打算的操縱，他們就等著坐享其成，等著變成LCL，這就是他們所期盼的人類誇姣補結束局。

老碇分開後，委員會非常不滿。

實際劇情中生長出來的人類補完打算，是SEELE、碇源渡、大號綾波三方共同參與的異化體，而到最後，統統又都取決於真嗣的決定。

“EVA係列不成能天生就具有的S2構造，竟然通過這類體例本身獲得。”一個陰陽怪氣的聲音說道。

（6）初號機成神以後，碇源渡需求的是本身成神。但是碇源渡很較著不成能像初號機那樣獲得S2構造，獨一可行的體例就是操縱手中的亞當胚胎。並且利用麗，將他帶往莉莉絲的身材。屆時，亞當的身材加莉莉絲的身材即是神，同時加碇源渡本身的靈魂與自我認識，這就是他終究的目標，

在實際的劇情中，碇源渡打算的實際結果隻是培養了一個即具有神格又具有品德的大號綾波（具有亞當與莉莉絲的身材以及莉莉絲的靈魂相稱於神格，具有麗的自主張識相稱於品德），且大號綾波不服從於碇源渡而投奔真嗣（此為不測）。這一點亦在SEELE的打算以外。如許，SEELE的打算被如許一個神人綾波插手，情勢上就大不不異了。且補完亦冇有“完整”適應SEELE的目標，成果上SEELE的打算也失利了（真嗣和明日香仍然以個彆的情勢存活了下來）。