危急消弭後，宇宙規複了安靜。楊遠航等人深知，將來或許還會有新的應戰，但他們仰仗著勇氣與聰明，一次次保護了宇宙的戰役。他們將持續保護基因之源，時候警戒未知的傷害，成為宇宙戰役的堅固保護者。

在狠惡比武中，小棠發明暗中權勢的兵器核心與之前碰到的奧秘晶體有著類似之處，她認識到這兵器或許能減弱基因之源的力量。而此時，地球上的林婉婷也有了新發明，她通過闡發被粉碎的嘗試樣本，找到了暗中權勢入侵的線索，並順著線索破解了部分暗中權勢的通訊暗碼，得知他們將在特定時候策動進犯，目標恰是存放基因之源的地球基地。

楊遠航和小棠趕回基地，插手戰役。暗中權勢的首級站在疆場上，暴露猙獰的笑容，要求交出基因之源。楊遠航等人毫不畏縮，兩邊展開狠惡戰役。暗中權勢的新型兵器啟動，強大的能量打擊向基因之源，試圖抵消其力量。

楊遠航等人帶著基因之源回到地球，本覺得能迎來長久安寧，可宇宙的危急並未真正消弭。地球的監測站俄然捕獲到一係列非常信號，追蹤之下發明竟是暗中權勢的殘存在悠遠星係集結，他們在一處燒燬星球建立奧妙基地，彷彿在醞釀一場可駭的詭計。

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楊遠航和小棠得知動靜後，立即趕回地球。可暗中權勢早已在地球四周佈下重重防地，他們衝破防地時，基地已經遭到進犯。保護基地的力量節節敗退，暗中權勢即將攻入存放基因之源的核心地區。林婉婷在基地內焦心腸批示著防備，汗水濕透了後背：“快撐不住了，你們到底甚麼時候返來！”

小棠儘力開釋基因之源的力量抵當，卻垂垂感到吃力。關頭時候，星耀趕到，帶來了宇宙中其他公理力量的援助。星耀操縱宇宙能量管束暗中權勢的兵器，楊遠航和林婉婷則帶領軍隊對暗中權勢停止反擊。疆場上，鐳射交叉，爆炸聲不竭，喊殺聲震耳欲聾。

小棠集合精力，深切貫穿基因之源與宇宙萬物的聯絡，她發明暗中權勢兵器的能量顛簸存在馬腳。她咬緊牙關，將基因之源的力量精準注入馬腳處，激發兵器內部能量混亂。跟著一聲巨響，暗中權勢的兵器被摧毀。

落空兵器的暗中權勢開端潰敗，首級見局勢已去，企圖掠取基因之源逃脫。楊遠航與他展開近身鬥爭，在世人的共同下，勝利禮服首級，完整粉碎了暗中權勢的詭計。