在彩虹和寶可夢大師！中，回到真新鎮的小智在幫忙大木博士尋覓走失的小火龍時和小茂相逢，麵對小茂所問的“成為冠軍以後間隔寶可夢大師另有多遠”這一題目，小智墮入了思慮。和皮卡丘一起躲雨時，小智找到了本身的答案。“成為冠軍並非起點，我仍然還是一個應戰者；我想和全天下的寶可夢成為朋友，那必然就是所謂的寶可夢大師”，對於何為真正的寶可夢大師，小智給出瞭如許的答覆。雨過晴和，小智看著麵前的彩虹，暴露了笑容，果斷了心中的信心，和皮卡丘商定即便成為寶可夢大師也要一向在一起。以後，小智換上了花子給的新鞋子，和皮卡丘一起，朝著成為心中神馳的寶可夢大師的目標，再次踏上無止儘的旅途。

在寶可夢！很歡暢終究碰到你啦！至小智與小豪！踏上新的旅途!!中，小智和小豪、小春來到之前小春和櫻木所長一起來的叢林裡露營，但是因為曲解，小智和小豪之間的友情碰到了一些題目。在小春的開導下，小智最後和小豪消弭了曲解。洛奇亞呈現後，小智和小豪向洛奇亞收回了個人戰，小智的皮卡丘、路卡利歐，以及小豪的敲音猴、閃焰王牌和千麵避役，一起應戰洛奇亞。固然大師共同默契，無法洛奇亞氣力過分強大，以後小豪試圖收伏洛奇亞，但是冇能勝利，大師反而差點被洛奇亞的氣旋進犯吹下絕壁，最後被洛奇亞所救，戰役間斷。不久後，小智離任櫻木研討所出風格查員身份，和小豪、小春道彆，以後和皮卡丘一起踏上了新的路程，期間與巴大蝶相逢，以及派前程卡利歐和路人練習家的拉普拉斯對戰。

在決賽篇Ⅰ“激流”至決賽篇Ⅳ“火伴”中，小智與丹帝停止一場6對6全麵對戰的總決賽。因在對戰之前丹帝提出能夠利用統統戰役體係的建議獲得了寶可夢天下錦標賽委員會的例外答應，小智得以將極巨化、超等退化、Z招式全數利用，儘力以赴應對丹帝的寶可夢。在對戰中，小智和他的寶可夢拚儘儘力，將丹帝拖入了拉鋸戰，此中更是讓快龍使出之前和真司特訓時自創的快龍流星群打敗了丹帝的多龍巴魯托。不過在丹帝的絕對氣力麵前，小智還是墮入了苦戰。在轟擂金剛猩接連打敗了已經被耗損的快龍和蔥遊兵後，場上局勢再次對丹帝無益。跟著鰓魚龍閉幕了轟擂金剛猩後被閃焰王牌輕鬆打倒，小智僅剩一隻皮卡丘來麵對丹帝的超極巨化噴火龍以及閃焰王牌。緊接著，麵對丹帝的超極巨化噴火龍，小智讓皮卡丘使出千萬伏特迎戰噴火龍的超極巨深淵滅焰。合法皮卡丘和噴火龍苦戰正酣之時，因為千萬伏特和超極巨深淵滅焰碰撞產生過大的能量，是以感到到這股能量的無極汰那俄然呈現在宮門競技場上空，其在平和了比賽現場的能量後，兩邊的極巨腕帶再次發光，各自分外獲得一次極巨化的機遇，因而小智和丹帝彆離讓皮卡丘和閃焰王牌停止超極巨化。在超極巨化對決中，皮卡丘克服了閃焰王牌，兩邊戰至5比5平。在最後的王牌對決裡，皮卡丘與噴火龍再次狠惡對抗。就在皮卡丘遭到噴火龍進犯後將要倒下時，它回想起了這一起走來與火伴們的相逢，在小智的鼓勵下再次固執地站了起來。在最後的十萬伏特與大字爆炎碰撞後，皮卡丘擊倒了噴火龍。至此，小智以6比5克服丹帝，成為了寶可夢天下錦標賽新的冠軍，同時閉幕了丹帝的不敗神話。冠軍頒獎典禮上，小智從丹帝手中接過冠軍獎盃，和他在大師錦標賽上的6隻並肩作戰的寶可夢一起合影，以及接管全場慶祝的掌聲。本屆寶可夢世錦賽也就此落下帷幕。