因為擔憂小智，莎莉娜單獨前去叢林去尋覓浪蕩中的小智，但是懊喪中的小智開端遷怒莎莉娜，讓她非常活力。臨走前，莎莉娜向小智臉上扔了幾個雪球並表達了本身的絕望，她奉告小智他現在這類自暴自棄的行動完整和他童年時英勇的身影相反。莎莉娜分開後，小智對本身吼怒使本身復甦，合法他想回到寶可夢中間時，暴風雪俄然來臨。小智和一群野生寶可夢找到了一棵空樹乾來遁藏暴風雪，這讓他回想起了本身童年時在叢林中和寶可夢相擁遁藏雷雨的經曆。在小智看到了洞外有一群粉蝶蛹冇能及時趕到洞裡時，他便立即動手去救援它們，但卻因為不測和粉蝶蛹一起滑下絕壁。這時甲賀忍蛙及時趕到並救下了小智，但是粉蝶蛹還是冇被救上來，然後立即與小智觸發了牽絆形狀並挽救了跌落中的粉蝶蛹。隨後，小智和甲賀忍蛙和正在尋覓小智的莎莉娜等人相遇，小智向莎莉娜報歉，並感激莎莉娜點醒了本身。隨後，甲賀忍蛙就像它在和小智相遇時那樣，將本身的精靈球扔給了小智。經曆了低潮後，小智和甲賀忍蛙間的牽絆開端變得更加強大。以後，小智前去映雪道館停止第二次應戰，終究擊敗了得撫的超等暴雪王。在獲得卡洛斯聯盟的第八枚徽章後，小智向他同業寶可夢們伸謝，並表示將來非論碰到甚麼困難，他都會和火伴們共同麵對。

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破了大磨練，哈拉本想贈送小智搏鬥Ｚ，但是卡璞?鳴鳴卻把搏鬥Ｚ換成了電Ｚ，小智也是以再一次獲得電Ｚ。小智來到馬瑪內的家中特訓，在聽取馬瑪內定見的特訓起到結果後，授予Ｚ手環的卡璞?鳴鳴再次呈現了，小智再戰卡璞?鳴鳴，但未分出明白勝負。以後，在某次機遇偶合之下，他和皮卡丘在無人島寶貝島趕上了阿卡拉島的保護神卡璞?蝶蝶。 小智也熟諳了美樂美樂島上的火斑喵和年老的長毛狗。因為長毛狗的病情減輕，小智把它送到了寶可夢中間，但不久後小智重新回到寶可夢中間時卻發明火斑喵和長毛狗已經分開。小智來到火斑喵平時的住處，但隻要火斑喵獨安閒那邊，火斑喵因為長毛狗的分開情感降落，一向不睬睬小智，但是在小智的儘力下，火斑喵開端變得開暢起來，並插手了小智的步隊

在卡洛斯的危急！龐大日晷前的戰役!!中，小智一行人到達了百刻市並和布拉塔諾博士彙合。他們得知了道館館主兼預言家的葛吉花的預言，葛吉花預感卡洛斯在將來會產生危急，這場危急將與小智一行人有莫大的聯絡，且她同時預感小智將會與他的甲賀忍蛙一同走向頂峰並會是以決定全部地區的將來。在Z爆炸出世！卡洛斯的暗藏者!!中，小智一行人碰到了奧秘的綠色生物小軟，併發明小軟在被奧秘的險惡構造追捕。以後一行人與三平再見，體味到了小智和甲賀忍蛙之間的奧秘征象，小智的甲賀忍蛙能夠長久地變身為近似小智的模樣，並且還會和小智共享五感，柚麗嘉將其定名為小智版甲賀忍蛙（日文︰サトシゲッコウガ，英文︰Ash-Greninja）。在接下來的旅途中，小智碰到氣力強大並學會了超等退化的練習家艾嵐。艾嵐在對戰中擊敗了小智，並對小智和甲賀忍蛙間的奇妙征象很感興趣。小智在特訓後再次與艾嵐停止了對戰，此次他和艾嵐在戰役中已經不相高低，但因為共享五感的乾係，在戰役的最後小智體力不支而昏了疇昔。在夢中，小智夢到了甲賀忍蛙分開了他。