孫稷俠參照戚繼光的《練兵記要》，給新軍製定了這個期間嚴苛的軍紀軍規，練習另有考覈，凡是成績在中下的，捆打；

為了能將軍紀完整履行，孫稷俠還在哨一級上設立了鎮撫，並裝備有一什憲兵，主抓全哨軍紀；營一級設立鎮撫使，兼顧全營軍紀；軍一級設置憲督，賣力全軍的軍紀事情。孫稷俠固然來自當代，對這類中世紀的動輒斬首極其惡感，但是他卻不得不實施，因為存期近公道，這個期間就是一個封建社會，你跟明朝兵士講人權，人家不但聽不懂，乃至會覺得你是神經病。戚繼光是這個期間最為燦爛奪目的名將，連他都推許斬首之刑，更加申明這有他的公道之處，孫稷俠不感覺本身能超出這個期間的名將。

埋伏作戰，遇賊不起及起早者，隊長斬，各兵捆打；

凡兵逃脫，同隊之人各捆打；

臨陣一人撤退則一人被斬首，全隊撤退則隊長被斬首，隊長殉職而全隊撤退則全隊被斬首；

凡臨陣畏縮，答應什長割兵耳，隊長割什長耳，哨官哨長割隊長耳，把總割哨官哨長耳，依此類推；