從各種史料和跡象推斷，順治患天花而歸天，這彷彿是最靠近本相的答案。但是令人費解的是順治得病歸天，應當屬於普通滅亡。但是清宮檔案為甚麼對順治的死因隻字未提，諱莫如深，莫非順治滅亡的背後還埋冇著甚麼不成告人的奧妙？

彆的，手抄本上另有一段關於太師鄭芝龍被害黑幕的筆墨，此中再次提到順治帝死因：太師鄭芝龍降清後，多次寫信勸兒子鄭勝利投降都以失利告終，但順治並未將他定罪。順治被炮斃於廈門後，輔臣蘇克薩哈與鄭芝龍有仇，向康熙建議：“鄭勝利能夠用炮擊死我們的先皇，皇上莫非就不能正法他的父親嗎？”康熙采取了他的定見，即位不久後，鄭芝龍就被正法。

官方傳說，明末清初，鄭勝利據島抗清，順治天子禦駕親征，來到廈門。鄭勝利的軍隊沿岸與清軍苦戰。就在這一次的苦戰中，順治天子被鄭勝利炮轟而死。港中江魚因食天子肉而形變，成了無鰾江魚。現在這個覆蓋著濃烈神話色采的傳說，在人們的口口相傳中已經變得恍惚不清，順治天子真的死在廈門海戰當中了麼？