1363年10月30日，陳友諒在湖口被射殺身亡，他被箭射穿了眼睛。

安徽南部和浙江仍然有待征服。1357年，朱元璋親身統軍占據寧國，三個月後，明軍統帥胡大海領兵攻占徽州。

陳友諒在九江擺設本身的水軍迎戰，在朱元璋飛行的途中，明軍從兩側包抄漢軍戰線，陳友諒喪失了一百多艘大小戰船，但他本身避過朱元璋的耳目，溯江而上去了武昌。

1362年2月，朱元璋主力軍隊開進南昌，他實際上接掌了陳友諒在江西的政治職位，也順利接過了這裡的主宰大權。

1364年明軍改製，在明軍中退役的老兵，即朱元璋在攻打陳友諒的時候親身帶領過的主力兵士被分撥成17個衛，這個個人的老兵被準予能夠完整退休。其他軍隊的人則被派去南京地區搞軍屯，明軍在春季裡停止休整或勞動。在此以後，朱元璋本人不再賣力詳細的軍事批示事情。

接著是廣西，兩個月以後，廣西全線投降。

筆試以後的第五天，中試者還要通過箭術、馬術、算數及法律品德的綜合才氣測試。並且洪武天子對峙箭術的首要性，他令國子監門生和其他州縣的門生都要對峙學習和練習這一項目。

朱元璋篡奪了陳友諒的一支完整的艦隊來擴大本身的海軍，而此次對陳友諒強大艦隊的打劫，使他在而後兩年中根基主宰了長江中遊的水域領地。

次日，明軍在江麵長進犯九江城垣，現在陳友諒已經脫身，朱元璋隻好派徐達去追逐陳友諒。徐達冇能趕上陳友諒，他在漢陽城外拋錨，因而徐達開端攻城，但還是冇有拿下漢陽。

但在朱元璋分開南昌以後，他才恍然警悟胡美的這兩個部下祝宗和康泰一向反對胡美投降，等明軍雄師隊分開南昌城，祝宗和康泰就突襲了南昌，他們用炮火轟掉城門，並洗劫了南昌城池，守將鄧俞被迫逃離南昌。

李文忠請胡德信和他的廣信軍馳援，但張士信和他的部下被邵榮極其難纏的名聲擾亂了軍心，背麵張士信被諸全的守軍和救兵夾攻打敗，而邵榮也在這時候光複了處州。

期間常遇春曾經試圖突襲杭州，但未勝利。同一期間，方國珍和他的艦隊持續節製浙江的東部海岸。

洪武五年之前，明軍又征服了三個省，山西、陝西和四川。四川是明朝獲得的最後一塊國土，明軍對四川的征服並冇有使他們在西南初創個新的安穩的期間，相反的是，明軍背麵對西部和南部地區的非漢族的其他民族展開了一係列綏靖戰役。