1941年，稅警總團第2、第3、第4團和直屬隊改編為陸軍新編第38師（第1、第5團則被軍統兼併，擔當各地關鍵構造和部分的保衛軍隊），孫立人任師長，齊學啟任副師長兼政治部主任，附屬於第66軍建製。新38師建立後插手軍政部校閱，其綜合戰役力名列第一，立即從丙種師晉升為加強師，編入緬甸遠征軍。在印緬作戰中最負盛譽的仁安羌挽救被圍英軍就是新38師。後遠征軍得勝後新38師撤入印度，接管美械設備與練習，並與新22師合編為新編第1軍，也就是國軍聞名的五大王牌主力之一。抗戰勝利後，又離開新1軍建製成為新編第7軍的骨乾，最後在1948年10月長春投誠。

1944年36師改隸第20個人軍54軍，插手了滇西反攻、強渡怒江、攻占騰衝等戰役。抗戰勝利後36師先是在廣東與束縛軍東江縱隊多有比武，迭有勝績。1946年改編為整編第36旅，旅長李誌鵬，附屬於整編54師，投入華東疆場，作為打擊膠東的主力，於1947年9月攻占平度。1947年12月初該旅106團及108團第1營在萊陽被殲，此役106團團長鬍翼烜率部死守十數日，最後僅率17人突圍，雖喪師失地，但該團以一團之孤軍獨拒束縛軍三個縱隊的圍攻，其固執精力也為國軍所少見，以是戰後胡翼烜團長升任少將旅長。隨後36旅重修106團。同月整編54師主力北調東北，36旅還是留在山東，轉隸整編45師，守備青島。