1937年7月抗日戰役發作,gmd於8月11日停止中心政治委員會第五十一次集會，集會為謀在作戰期間同一批示黨政軍統統事項，將原設立的國防集會及國防委員會歸併，設立國防最高集會，同時將原國防集會撤消.

第四部該部於1937年8月20日建立，掌國防經濟：任命吳鼎昌為部長，何廉、黃季陸為副部長。1938年1月該部歸併於經濟部及有關各部。

2、軍政部

大本營建立後．為動員構造天下抗戰，頒佈《國軍作戰指導打算》、《第三戰區作戰指導打算訓令稿》等訓令，同時．將天下分彆為5個戰區，組建4個預備軍和利組建多少個個人軍，批示了華北方麵的抗戰和淞滬會戰等。8月30日蔣介石決定，仍以軍事委員會為抗戰最高統帥部．不另設大本營，原大本營所設各部均轉隸軍事委員會，大本營於1938年1月正式撤消.

交通司司長王景祿。抗日戰役發作後，因為交通停業日趨沉重，連續增設汽車、燃料、經理3個科.

權軍事委員會對黨政軍實施同一批示.8月20日,《大本營國軍作戰指導打算訓令》曾擬議建立大本營，率領陸海空軍及指導全民抗戰．以下建立第一至第六部及火線勤務、辦理、衛生勤務等各部，作為辦事機構。8月30日蔣介石決定，以軍事委員會為抗戰最高統帥部，不另設大本營,原大本營所屬第一至第六部及辦理部歸軍事委員會統轄。9月8日為整肅軍隊又建立軍法履行總監部。設立國度總動員設想委員會，蔣介石兼主任。9月17日gmd中心常務委員集會決定，由軍事委員會委員長利用陸海空軍最高率領之權，並受權軍事委員會對於黨政實施同一批示。在其之下，又接踵設立農產調劑委員會，以周作民為主任委員；工礦調劑委員會，以翁文灝為主任委員；貿易調劑委員會，以盧作孚為主任委員。11月又在3個委員會之下設立水陸運輸結合辦事處。是年11月26日gmd中心常務委員會集會通過《非常期間黨政機構調劑及職員分散體例》，此中關於軍事委員會的有：中心黨部之構造、鼓吹、練習3個部暫歸軍事委員會批示，其職掌與總動員委員會有乾係者，歸併國度總動員設想委員會辦理．貿易調劑委員會改隸行政院財務部，禁菸委員會改隸行政院內政部。所建6個部有的歸併，有的打消，並由參謀總長訂定軍事委員會其他單位機構調劑體例。