而清軍和日軍達到朝鮮以後，東學軍魁首全琫準等人鑒於持續對抗會引發本國武裝乾與，便放棄了“驅兵入京”的打算，同意和朝鮮當局構和，“相議官民相和之策”。嚴世永、洪啟薰等人被迫承諾東學軍提出的12條鼎新計劃，此中包含嚴懲貪婪殘暴的官吏、兩班和富豪，打消封建品級軌製，拔除苛捐冗賦和公私債務，拔除奴婢和賤民軌製，嚴懲私通日本者，均勻分派地盤等，史稱全州和議。同時，當局還“許置執綱於各郡”。6月11日，東學軍撤出全州。東學軍在其節製區內的53個郡縣建立執綱所，作為本身的政權機構，以貫徹履行全州和議的12項鼎新計劃，辦理本地統統事件。史載“因而東徒盤據各邑，設執綱所於公廨，置書記、省察、執事、童蒙之名色，宛成一官署，日以討索民財為事。所謂邑宰隻馳名位，不得行政，甚者逐送邑宰”。全州和議達成標記取甲午農夫戰役第一階段結束。