而後，楊廣下了一道的聖旨，以天子的身份對前麵幾次的征遼事件做出總結，聖旨稱“往年出車問罪，將廟遼濱，廟算勝略，具有進止。而諒昏凶，罔識成敗，高熲愎恨，本無智謀，臨全軍猶兒戲，視性命如草芥，不尊陳規，坐貽撓退，遂令滅亡者眾，不及埋藏。今宜遣令人分道收葬，設祭於遼西郡，立道場一所”。

來護兒剛打了敗仗，一雪前次平壤敗北之恥，且水軍隨船帶糧有運輸前提，士卒士氣較高，對戰役遠景持悲觀態度。接到回師詔令，來護兒大為不滿，即調集部眾喊：“三度出兵，未能平賊，此還也，不成重來。今高麗困弊，野無青草，以我眾戰，不日克之。吾欲進兵，徑圍平壤，取其偽主，獻捷而歸”。不肯奉詔，上表請戰。長史崔君肅以為詔命不成抗，來護兒激憤地說：“吾在閫外，事合專決，豈容千裡稟聽陳規，俄頃之間，動失時緣，勞而無功，故其宜也”。

聖旨中楊廣對於為征遼奇蹟獻身於遼東的文武將士表達了可惜悲憫之情，同時派人收葬棄於荒漠的隋征遼兵士骸骨，設立道場祭壇超度死者亡靈。但是作為傲岸的天子楊廣並冇有在聖旨中坦承本身前兩次征遼的失利，反而把本身親征失利時在遼東留下的將士骸骨歸為開皇年間弟弟楊諒和宰相高熲時留下的，這也是作為天子楊廣的無法之舉，因為他是天子，即便曉得本身錯了他不能正大光亮的承認本身的錯。但在仲春23日楊廣下詔第三次禦駕親征高句麗的聖旨中他還是以“黃帝五十二戰，成湯二十七征，方乃德施諸侯，令行天下”含蓄的承認本身的前兩次征遼的失利。

他以為勝利進軍中未達目標俄然退兵太草率，表示寧肯開罪也要擒得高元，況舍此勝利機遇，此後就不會再有了。來護兒為了滅掉高麗，不吝抗旨都要出兵，實在是很輕易瞭解的作為將軍的痛苦。一向以來大隋的將帥在疆場上不管是南陳還是突厥都是無往而不堪的，可對於他們眼中的彈丸之地的高句麗竟然三次傾天下之力都冇有將其滅掉，而現在趁勝有機遇完整征服它卻讓他出兵返國不讓他們抓狂才該。這時，崔君肅也大聲向眾將喊叫：“若從元帥，違拒聖旨，必將聞奏，皆開罪也”。諸將驚駭，都勸來護兒奉詔退兵，護兒無法，隻好率海軍回還。本來另有一點但願的第三次出征就如許因為崔君肅的怯懦不想出征而幻滅。

固然一起上各地事情的動靜不竭傳來，但有點無法的楊廣隻要一麵發詔各地官員征討彈壓，一麵持續行軍。因為流亡不竭。路程很慢，走了近3個月，七月17日楊廣的車駕才趕到塞外遼河邊上的懷遠鎮（今遼寧懷遠縣）。身為天子的楊廣雖又一次親臨火線，但本來征發的軍隊多負約不至。兵士好戰，夫子流亡，加上秋涼已到，時候未幾，隋軍雖多，但實際上戰役的但願非常讓人擔憂。此時，來護兒率水軍泛海先於遼東半島登岸，占據了高句麗的畢奢城（今遼寧大連市北）。但水軍副總管周法尚則在進軍途中遇疾而亡。死時遺言以未能親見滅高句麗而遺憾。高句麗舉兵迎戰來護兒軍，被擊敗，來護兒因而勒兵將轉攻平壤。高麗王高元震恐，比年守土作戰已人疲馬乏，本身又主動破壞稼禾，實施堅壁清野，雖頂住了隋軍打擊未致亡國，但三年不種稼穡，野無青草，舉國饑荒，亦行動困弊，天下大饑有力再戰，因而遣使執送隋叛臣斛斯政於遼東城（今遼寧遼陽市）下，上表乞降。